研究报告

梨ERF超家族全基因组鉴定及表达分析  

钟必凤 , 邓家林 , 李文贵 , 张全军*
四川省农业科学院园艺研究所, 农业部西南地区园艺作物生物学及种质创制重点实验室, 成都, 610066
作者    通讯作者
《分子植物育种》印刷版, 2019 年, 第 17 卷, 第 9 篇   
收稿日期: 2018年04月12日    接受日期: 2018年05月30日    发表日期: 2019年08月08日
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摘要

中国南方地区普遍存在的由于干旱等原因提早落叶导致的梨二次花现象给生产带来了很大的损失,且该过程可以通过人工摘叶处理进行模拟诱导。乙烯响应因子 ERF 成员被认为参与了植物的激素应答、生物和非生物胁迫以及生长发育调控过程。本研究基于公开的白梨基因组序列,利用生物信息学方法对其中的 ERF 因子进行鉴定,并对其分组及各组结构域进行了详细分析。结合课题组采用摘叶诱导二次花形成过程中的梨转录组数据,分析了响应该过程的 ERF 成员。结果表明,共获得了 211 个白梨 ERF 家族编码基因,并可根据系统进化关系和结构域保守性分为 11 个组,其中种特有组一个。砂梨摘叶诱导二次花过程的转录组数据分析表明,有 37 ERF 因子差异表达,摘叶初期(摘叶后 7 d)无响应,中期(摘叶后 17 d)以下调表达为主,后期上调。对其中的 4 个差异表达基因进行了实时荧光定量 PCR 分析验证,结果与转录组分析结果吻合。此研究进一步丰富了梨响应胁迫反应的 ERF 基因资源,为进一步探讨 ERF 在成花过程中的作用提供了理论依据。

关键词
梨;乙烯响应因子;二次花;基因家族

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《分子植物育种》印刷版
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